根据《中华人民共和国税收征收管理法》第三十一条第一款、第三十二条、第六十四条第二款、第六十九条、《国家税务总局关于贯彻<中华人民共和国税收征收管理法>及其实施细则若干具体问题的通知》(国税发【2003】47号)以及《国家税务总局关于印花税违章处罚有关问题的通知》(国税发【2004】15号)规定,对公司未申报缴纳2012年度印花税4179.50元、企业所得税2231.63元、2013年度企业所得税11,402.47元和应扣未扣2012年度个人所得税38,174.90元、2013年度个人所得税39,689.31元、2014年度个人所得税33,250.61元责令限期补缴入库。同时处以罚款,罚款金额共计为64,464.21元。