1950年5月，中国民航局在广州设立南航的前身--军委民航广州办事处，
1959年1月，正式成立民航广州管理局
1969年，民航广州管理局组建运输服务队，开始管理及调配自己的机队
1984年，中国民航局进行重组，将其业务部门分拆为4个主要的航空公司
1991年2月1日，民航广州管理局下辖“中国南方航空公司”正式挂牌成立，期间公司逐渐开展了对外交流及拓展业务。
1990年，南航与香港和记黄埔、美国洛克希德共同组建了“广州...
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1950年5月，中国民航局在广州设立南航的前身--军委民航广州办事处，
1959年1月，正式成立民航广州管理局
1969年，民航广州管理局组建运输服务队，开始管理及调配自己的机队
1984年，中国民航局进行重组，将其业务部门分拆为4个主要的航空公司
1991年2月1日，民航广州管理局下辖“中国南方航空公司”正式挂牌成立，期间公司逐渐开展了对外交流及拓展业务。
1990年，南航与香港和记黄埔、美国洛克希德共同组建了“广州飞机维修工程有限公司”（GAMECO），至1991年，南航共有38架波音飞机飞往90个国内航点及12个国际航点，年发送旅客量达600万人次。
1992年12月20日，中国民用航空局实施体制改革，中国南方航空公司与民航广州管理局正式分开，成为自主经营、自负盈亏的经济实体，直属中国民用航空局
1993年1月，中国南方航空公司被国家批准更名为“中国南方航空（集团）公司”，并以公司为核心企业组建中国南方航空集团。同年，南航还与波音签署了订购6架波音777客机的订单
1995年12月28日，南航的首架波音777交付使用
1996年，首个洲际航线为广州经北京至阿姆斯特丹正式开办 。
1997年，南航又开设了一条越太平洋的洲际航线：广州至洛杉矶
1997年7月，公司成功在纽约及香港的证券交易所同步上市
2000年7月，中国民用航空局宣布，其直接管理的10家航空公司将整合为中国三大航空集团：中国国际航空、中国东方航空和中国南方航空。8月4日，南航率先收购中原航空；次年又先后并入新疆航空、中国北方航空及其下属北亚航空和天鹅航空的国内业务。此外，南航还先后增持了中国众多航空公司的股票，为厦门航空（51%）及重庆航空（60%）的控股公司，并且是四川航空（39%）的股东之一。
2003年，公司随后也在上海证券交易所上市。
2003年9月29日，南航向空中客车订购了4架A330-200系列客机。
2005年1月29日上午8时正，搭载234名台商的南航CZ3097班机由广州白云国际机场起飞，并于9时20分首先降落台北中正国际机场
2006年10月19日，南航向波音订购了6架波音777货机，同年12月30日，中国南方航空开通由北京经迪拜至尼日利亚拉各斯的航班，该航线曾受全球金融危机和国际油价大幅波动的影响而停航，但在2009年4月11日成功复航。
2007年9月6日，南航宣布其向波音增购了55架新一代B737-700和B737-800以扩大其机队规模，10月23日，南航又与空中客车就购买10架A330-200飞机签订合同
2007年11月15日上午，南航在北京人民大会堂举行隆重仪式，宣布正式加入天合联盟。
2009年，南航与深圳签署协议，南航建成国内首家“白金机场”，南航与中移动签署战略合作协议，南航台湾分公司成立，南航与大韩航扩大代码共享合作。
2009年6月25日，中国南方航空公司和广州亚组委在广州举行签约仪式，正式成为2010年亚洲运动会的官方合作伙伴
2010年，中国银联与南航建立全面合作伙伴关系，海南省政府与南航签订战略合作协议，南航与人保财险签署战略合作协议
2010年1月20日，南航又与空中客车签订了购买20架A320系列飞机的协议，同年3月，中国南方航空在上海及香港增发了价值107.5亿元人民币（约合15.7亿美元）的新股，12月，南航为子公司厦门航空引入新股东，并注资14.6亿元人民币
2011年，南航先后新增奥克兰、第比利斯、温哥华等航点
2011年，中国南方航空公司首架A380飞机成功完成首飞
2011年10月15日，中国南方航空公司在首都机场接收了第一架空客A380
2012年9月24日，南方航空与国企河南民航发展投资有限公司订立合资合同协议成立合资公司中国南方航空河南航空有限公司
2013年6月2日，中国南方航空公司在广州新白云机场接收了中国第一架从西雅图艾弗雷特机场发出的波音787。
2015年度，公司营收1114.67亿元，同比增加2.91%；归属净利润38.51亿元，同比增加117.20%。累计完成客运量10942.1万人次，同比增长8.42%；累计完成货运量151.15万吨，同比增加5.44%，货邮业务收入68.61亿元。引进B777-300ER、B787等飞机58架，年末集团拥有飞机达到700架，机队规模稳居亚洲第一，世界第四。
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