主要观点：
　　事件：
　　公司发布2026年三季报，2026年前三季度，公司整体经营基本面迎来向好发展，主营业务收入实现210,771.73万元，同比增长11.91%，公司全球四大销售区域营收保持全线增长趋势；利润总额为-12,729.66万元，同比减亏47.03%，若剔除汇兑损益影响，利润总额同比大幅减亏83.18%；归母净利润为-18,703.79万元，同比减亏14.76%，整体经营情况明显改善。
　　点评：
　　26Q3收入增长有所波动，毛利率提升，期间费用优化
　　公司2026年3月完成对三箭齐发、华大序风的同一控制下合并并追溯重述报表，调整后2026Q3收入端同比增速+1.65%。未合并前口径2026Q3单季营收7.84亿元，同比+3.77%，2026Q1/Q2收入增速则分别为28.63%/18.52%，第三季度的收入增速有所下降，主要与公司收缩低价设备销售的战略相关。公司前三季度毛利率为57.89%（同比+3.84pct）、2026Q3单季毛利率为59.39%（同比+5.14pct、环比+3.51pct），近年单季最高，这主要是公司试剂类收入占比提升，带动了整体毛利率提升。前三季度期间费用（不含财务）12.28亿元、同比-8.25%，其中销售费用率22.85%（同比-4.71pct）、管理费用率15.10%（同比-2.01pct）、研发费用率19.17%（同比-5.87pct），公司收入保持增长同时而三项费用合计下降，也说明公司的降本增效措施有效。经营活动产生的现金流量净额由去年同期的-41,930.25万元显著改善为44,982.04万元，已连续四个季度实现经营净现金流入，经营现金转化能力和自我造血能力进一步增强。
　　股权激励计划落地，助力公司提质增效
　　公司2026年股权激励方案于2026年9月落地，公司设置2026-2028年三年的考核目标，以公司2025年为业绩考核基准年度，对各考核年度不含北美区域的营业收入增长率（A）、经调整后的EBITDA增长率（B）、不含北美区域的试剂耗材收入增长率（C）进行考核。各考核指标设置不同的考核权重，其中不含北美区域的营业收入增长率（A）权重为40%，经调整后的EBITDA增长率（B）权重为40%、不含北美区域的试剂耗材收入增长率（C）权重为20%。不含北美区域的营业收入，目标值2026-2028年较2025年增长分别为10%、21%和33.1%；经调整后的EBITDA增长率目标值2026-2028年较2025年增长分别为120%、160%和200%；不含北美区域的试剂耗材收入增长率目标值2026-2028年较2025年增长分别为15%、32.3%和52.1%。
　　投资建议：维持“买入”评级
　　预计公司2026-2028年营业收入有望分别实现31.15/38.43/47.40亿元，同比增长12.1%/23.4%/23.3%；归母净利润分别实现-1.92/0.72/1.96亿元，同比增长13.5%/137.6%/171.0%；对应EPS为-0.46/0.17/0.47元；对应EV/EBITDA倍数为61/49/34X。维持“买入”评级。
　　风险提示
　　联盟集采执行滞后，业绩承诺实现不及预期，海外业务收入不及预期。

MGI reported 9M26 revenue of RMB2.15bn (+12.0% YoY) and a pretax loss of RMB127mn (narrowing 47.0% YoY, or 83.2% excluding FX gains and losses). Attributable and recurring attributable net losses were RMB187mn and RMB196mn, respectively (narrowing 14.8%/17.5% YoY). In 3Q26, revenue reached RMB784mn (+1.7% YoY), while the pretax result approached breakeven excluding FX gains and losses. Attributable and recurring attributable net losses were RMB30mn and RMB35mn, respectively (narrowing 43.6%/51.1% QoQ). The improvement mainly reflected a higher revenue contribution from reagents and consumables, alongside cost reductions and efficiency gains. We expect the installed base of sequencers to drive reagent and consumable volumes, while the rollout of new multiomics products could support further improvement in operating performance. Maintain BUY.

　　核心观点
　　事件：公司发布2026年三季度报告。2026年1-9月实现营收21.50亿元（+11.98%），归母净利润-1.87亿元（亏损同比收窄），扣非净利润-1.96亿元（亏损同比收窄），经营活动现金流净额4.50亿元（由负转正）。2026Q3营收7.84亿元（+1.65%），归母净利润-0.30亿元（亏损同比收窄），扣非净利润-0.35亿元（亏损同比扩大）1。
　　全球业务稳步拓展，经营质量整体改善。2026Q3公司营业收入同比略有增长、增速有所回落，除去年同期基数较高影响以外，预计主要是设备类收入确认节奏存在季度间波动，公司全球四大销售区域营收保持全线增长趋势。从利润端来看，公司亏损同比收窄，一方面主要是试剂收入占比提升，导致毛利水平改善（2026年前三季度同比+3.84pct）；另一方面，由于收到历史退税款等原因，所得税费用较同期有所下降。此外，公司提质增效效果持续显现，经营活动产生的现金流量净额已连续四个季度为正，2026Q1-3期间费用（不含财务费用）同比-8.25%，销售/研发/管理费用率分别-4.7pct/-2.0pct/-5.9pct至22.9%、15.1%、19.2%。
　　持续夯实核心壁垒，激励目标指引成长。公司持续向“AI驱动的生命科学核心工具提供商”转型，是全球唯一同时覆盖短读长、长读长与时空组学三大核心技术的企业，同时布局“技术授权+收益共享”的轻资产出海模式，有望加速扭亏进程并规避地缘政治风险。2026年9月，公司发布2026年限制性股票激励计划，拟授予834万股、占总股本2%，授予价38.36元/股，覆盖370名核心人员、骨干，以2025年为基准，设置三年复合考核：非北美营收增速（+10.0%、+21.0%、+33.1%）、经调整EBITDA增速（+120%、+160%、+200%）、非北美试剂耗材增速（+15.0%、+32.3%、+52.1%），三项权重分别为40%、40%、20%。
　　投资建议：华大智造是技术立身、放眼全球的国产测序仪龙头，以核心技术和超强产品力筑就高竞争壁垒，随着新产品上市及平台迭代升级、整合协同丰富产品矩阵、海外业务模式积极转型，全球市场空间有望进一步打开。考虑到设备类收入季度波动，我们调整公司2026-2028年营业收入预测至30.99亿元、35.81亿元、41.18亿元，同比+11.48%、+15.57%、+14.98%，同时考虑公司核心业务处于市场开拓期，各项成本费用投入仍较大，对应调整2026-2028年归母净利润预测至-1.20亿元、0.53亿元、1.72亿元，则2026-2028年EPS分别为-0.29/0.13/0.41元，当前股价对应2026-2028年PS分别为8/7/6倍，维持“推荐”评级。
　　风险提示：行业竞争加剧的风险、海外政策及经营环境风险、市场拓展不及预期的风险、新产品研发进度不及预期的风险、市场竞争加剧的风险、海外业务经营效果不及预期的风险。

　　公司1-3Q26实现营收21.50亿元（+12.0%yoy），利润总额为-1.27亿元（同比减亏47.0%，剔除汇兑损益影响后同比减亏83.2%），归母/扣非归母净亏损1.87/1.96亿元（同比减亏14.8%/17.5%）；其中3Q26营收7.84亿元（+1.7%yoy），剔除汇兑损益影响后利润总额趋近盈亏平衡，归母/扣非归母净亏损0.30/0.35亿元（环比减亏43.6%/51.1%），业绩改善主要受益于试剂耗材收入占比提升及降本增效。我们看好测序仪存量装机带动试剂耗材放量，叠加多组学新品推广，公司经营质量有望持续改善。维持“买入”评级。
　　经营现金流持续转正，毛利率延续改善
　　1-3Q26公司经营活动现金流净额4.50亿元（上年同期为-4.19亿元），其中3Q26经营活动现金流净额1.49亿元（连续四个季度转正），公司持续加强销售回款及营运资金管理，经营端自我造血能力显著增强。1-3Q26公司毛利率57.9%（yoy+3.84pct），高毛利试剂耗材收入贡献提升推动整体毛利率改善。1-3Q26公司销售/管理/研发费用率分别为22.9%/15.1%/19.2%（yoy-4.7/-2.0/-5.9pct），公司持续优化营销、管理及研发资源配置。考虑收入规模增长及提质增效措施推进，我们看好公司费用投入效率进一步提升。
　　测序平台持续升级，有望推动业务快速增长
　　年内公司测序平台升级迭代持续取得突破，短读长与长读长产品布局进一步完善。我们看好平台技术升级及应用场景拓展，推动测序业务快速增长：1）超高通量平台T7+：已在海内外多家客户部署，单机全年可支持3.5万例全基因组测序，运行成本较此前下降50%。2）中高通量平台T1+：配套小规格载片并进一步补齐时空组学测序能力，有望满足不同样本量及研究场景的检测需求。3）长读长测序平台CycloneSEQ：新一代S1体系提升准确率、通量及读长，进一步拓展复杂结构变异及甲基化检测等应用，打开科研及临床市场空间。
　　多组学与智能自动化应用持续拓展
　　1）多组学：GoSpatial全自动时空一体机升级、全球首个单细胞自动化平台正式交付，显著提升时空组学研究的效率与操作灵活性。考虑药物研发及科研对高质量组学数据的需求，我们看好多组学业务延续高速增长。2）智能自动化：公司持续升级自动化移液、一体化检测及智惠实验室方案，拓展临床检测、药物研发及合成生物等应用。随着产品交付及智能实验室应用拓展，我们看好板块稳健增长。
　　盈利预测与估值
　　考虑行业竞争影响，我们略下调全年收入预测，叠加汇率波动对利润形成阶段性扰动，我们预测26-28年营收31.91/37.48/42.92亿元（相比26-28年前值下调3%/3%/3%），归母净利润-1.00/0.48/1.50亿元（相比26-28年前值下调170%/58%/38%）。考虑公司在基因测序领域具备核心技术优势,国内外市场地位持续提升，给予26年PS估值11x（可比公司均值7x，考虑AI大模型发展带动大规模测序及多组学数据需求增长，给予一定估值溢价），对应目标价84.28元（前值86.79元，对应26年PS估值11x）。
　　风险提示：市场竞争加剧风险；关联交易占比较高风险；国际贸易摩擦风险。

　　投资要点
　　业绩延续改善趋势，二季度减亏与现金流转正验证经营拐点。
　　2026年上半年，公司实现营业收入13.66亿元，同比增长18.91%；
　　实现归母净利润-1.58亿元，同比减亏6.41%，收入保持较快增长，核心经营亏损进一步收窄。公司综合毛利率同比提升约3个百分点至57.03%，主要受益于测序试剂耗材收入增长、业务结构优化及生产效率改善。单二季度实现营业收入7.81亿元，同比增长18.52%；归母净利润约-0.52亿元，较一季度明显减亏。26H1公司销售、管理及研发费用分别为3.22亿元、2.04亿元和2.77亿元，同比分别下降6.81%、13.07%和18.38%，提质增效成果持续体现。
　　核心测序业务恢复增长，试剂耗材放量强化“装机带动耗材”商业模式。26H1，公司全读长测序业务实现收入10.62亿元，同比增长17.64%，核心基本盘延续复苏。其中，试剂耗材收入同比增长16.28%，设备收入同比下降6.37%，收入结构进一步向高黏性、可重复销售的耗材业务倾斜。随着前期测序仪装机规模不断扩大，存量设备开始持续转化为试剂、芯片及配套耗材需求，仪器装机到耗材复购的商业闭环逐步兑现。其中，中国大陆及港澳台地区试剂收入同比增长28.09%，带动该区域全读长测序业务收入同比增长8.45%，国产替代仍是核心增长驱动力。产品端，公司已形成覆盖超高通量、桌面级和便携式应用场景的完整测序平台，T7+、T1+及E25等产品持续完善全通量矩阵。
　　多组学业务保持高速增长，全栈式技术平台打开第二成长曲线。
　　公司持续由单一测序设备供应商向覆盖短读长测序、长读长测序、时空组学、实验室自动化及数据分析的生命科学核心工具平台升级。报告期内，公司完成对杭州序风和深圳三箭齐发的收购，将CycloneSEQ纳米孔长读长测序和Stereo-seq时空组学技术纳入上市公司体系，进一步补齐长读长与空间维度的数据获取能力，形成行业内少有的“短读长+长读长+时空组学”一体化技术布局。26H1，公司多组学业务实现收入1.62亿元，同比增长44.91%，成为增长最快的业务板块。
　　其中，细胞组学收入同比增长94.29%，时空组学收入同比增长41.34%，显示新技术平台的商业化进程持续加快。
　　AIforScience战略加速落地，实验室自动化向智能化升级。
　　公司围绕PhysicalAI在生命科学场景中的应用设立“涌生智能”，并持续推进实验室自动化、智能实验设计及数据分析平台的融合。公司与上海人工智能实验室联合发布ProtoPilot多智能体系统，尝试打通实验方案设计、自动化执行、过程监控和数据分析等环节，推动传统实验室由单点设备自动化向“干实验+湿实验”闭环智能化升级。
　　公司现有的测序仪、样本前处理系统、实验室自动化设备及多组学数据平台，为AI模型提供了高质量数据和物理执行基础；AI系统反过来亦有望提升实验效率、设备利用率及客户黏性。AI业务有望打开AI制药、自动化实验室及科研基础设施等中长期增量市场。
　　海外收入较快增长，轻资产调整有望降低地缘政治与经营负担。
　　26H1，公司海外收入达到4.83亿元，同比增长33.77%，全球化业务继续保持增长。其中，亚太区收入同比增长5.12%，扭转此前下滑趋势；欧非区收入同比增长11.83%，保持稳健；美洲区收入同比增长95.76%，增长主要来源于公司与SwissRockets围绕CoolMPS技术验证确认的技术服务收入。公司拟将美国子公司CompleteGenomics部分自发光测序业务相关资产出售给SwissRockets，并同步推进技术授权安排。交易完成后，公司北美经营模式有望由重资产直接运营逐步转向“技术授权+产品供应+收益分成”的轻资产模式，降低海外人员、合规及运营成本。
　　盈利预测与估值
　　预计公司2026-2028年营业收入分别为31.98/36.80/43.66亿元，归母净利润分别为-0.1/1.02/2.13亿元，EPS分别为-0.02/0.24/0.51元，当前股价对应PE分别为-2616.6/255.6/122.4倍。
　　风险提示：
　　临床测序需求及国产替代进度不及预期风险；测序仪装机后开机率和试剂耗材产出不及预期风险；行业竞争加剧风险。

　　事项：
　　公司发布财报，26Q1-Q3营收21.50亿元（+11.98%），利润总额-0.55亿元（扣除汇兑影响，同比减亏83.18%），归母净利润-1.87亿元（同比减亏14.76%）。26Q3营收7.84亿元（环比增长0.39%），利润总额-0.04亿元（扣除汇兑影响，趋近盈亏平衡），归母净利润-0.30亿元（环比减亏43.55%）。
　　评论：
　　测序业务稳健增长，多组学表现亮眼。分业务看，26Q1-3全读长测序业务（SEQALL）实现收入16.9亿元，同比增长11%，为收入核心板块，占主营收入约80%；智能自动化业务（GLI）收入1.8亿元，同比下降6%，国内市场仍处于客户结构调整和产品转化阶段，商业化进程稳步推进；多组学业务（OMICS）收入2.4亿元，同比大幅增长39%，增长主要由细胞组学、时空组学驱动。
　　试剂占比提高拉动测序业务毛利率提升。前三季度SEQALL业务按照产品类型拆分，仪器设备实现收入4.5亿元，同比下降7%；试剂耗材实现收入10.4亿元，同比增长10%；服务及其他实现收入1.9亿元，同比增长116%。SEQALL业务毛利率同比提升约4pct至61%，受益于试剂占比提高。
　　国内增速阶段性放缓，美洲区实现高速增长。26Q1-3中国区全读长测序业务实现收入10.6亿元，同比增长4%，国内受去年同期装机高基数及客户预算周期影响，新增装机节奏阶段性放缓，但存量设备上机饱和度持续提升，国内NGS临床应用正处于注册、收费、支付和应用规范协同完善的关键阶段，行业景气度有望逐年改善；亚太区全读长测序业务实现收入1.2亿元，同比增长8%；欧非区全读长测序业务实现收入2.3亿元，同比增长3%；美洲区全读长测序业务实现收入2.8亿元，同比增长68%，主要系美洲区域存量测序设备高效稳产、上机饱和率持续攀升以及公司与SwissRockets达成的CoolMPS等测序技术相关技术服务合作。
　　多项核心经营指标改善。Q1-3费用（不含财务费用）为12.28亿元（-8.25%），销售费用下降7.15%至4.91亿元，管理费用下降1.20%至3.25亿元。经营现金流4.50亿元（同比转正），单Q3经营现金流1.49亿元（连续四季度为正），单Q3利润总额-0.04亿元（扣除汇兑影响，趋近盈亏平衡）。
　　投资建议：公司作为国产测序仪龙头，在当前国内行业景气度有望逐年改善，海外布局持续深化，以及AI4S为行业带来更多增量的背景下，业绩有望长期向好，利润端也有望迎来扭亏拐点，长期成长空间巨大。我们预计26-28年归母净利润分别为-1.00、0.64、1.87亿元。基于PS估值，给予公司27年8倍PS，目标市值约291亿元，目标价约70元，维持“推荐”评级。
　　风险提示：1、海外开拓进度不及预期；2、国内市场渗透进展不及预期；3、汇率波动风险；4、地缘政治风险。

　　事件：公司发布2026年半年度报告。2026年上半年，公司实现营业收入13.66亿元/+18.91%；归母净利润-1.58亿元，同比减亏6.41%；扣非归母净利润-1.61亿元，同比减亏20.95%；经营现金流净额3.00亿元，转正增长。利润总额-1.06亿元，同比减亏52.32%，若剔除汇兑损益影响，利润总额同比大幅减亏83.73%。
　　2026年单二季度，公司实现营业收入7.81亿元/+14.84%；归母净利润-0.52亿元，同比转亏；扣非归母净利润-0.72亿元，亏损同比扩大22.55%。
　　试剂放量，多组学高增，利好政策推动产业趋势向好。2026年上半年，分业务板块，全读长测序收入10.62亿元/+17.64%，其中试剂耗材收入同比增长16.28%，设备收入同比下降6.37%，存量装机正在加速转化为高毛利、高粘性的经常性试剂收入；智能自动化收入1.16亿元/+4.05%；多组学收入1.62亿元/+44.91%，保持高增长态势。
　　政策层面，自2025年底以来，《病理类医疗服务价格项目立项指南（试行）》、《肿瘤基因变异检测试剂技术审评要点（试行）》及《抗肿瘤药物与原研伴随诊断试剂同步开发有关事项的通知》等利好政策相继出台，有助于打通临床基因检测的产业堵点，推动下游需求景气度持续提升。
　　AI驱动的生命科学核心工具提供商。多组学数据已成为AI制药的核心燃料。在智能自动化领域，公司通过子公司涌生智能打造“AIforBio自进化实验室”，实现从实验意图理解到湿实验执行的完整闭环，推动实验室向自主决策、持续迭代的AI原生体系升级；在全读长测序领域，公司与GoogleResearch、NVIDIA等合作训练AI变异检测模型，最高可降低73%的基因组分析错误，并推出搭载AI智能交互的aCube数据一体机及开源工具PanVariants。
　　盈利预测及估值：我们调整盈利预测，预计公司2026-2028年营业收入分别为31.40、37.09、44.17亿元，同比增长13.0%、18.1%、19.1%；归母净利润为-0.80亿元、0.92亿元、2.97亿元。对应2026年8月21日收盘价，PS为9.9、8.4、7.1倍，维持“增持”评级。
　　风险提示：下游需求不及预期的风险；公司新产品市场推广不及预期的风险；国际地缘政治环境不确定的风险；行业竞争加剧程度超出预期的风险。